Un agent de l'ATF sous couverture est démasqué et tué par les Yakuzas qu'il avait infiltrés. Le NCIS doit déterminer au plus vite si d'autres agents sous couverture sont en danger. En Afghanistan, Granger s'inquiète de la disparition de Kensi, ignorant que celle-ci est partie à la rencontre du fantôme blanc…