Le secrétaire d'état à la Navy est tué dans un attentat à la bombe tandis que Tom Morrow, l'ancien directeur du NCIS, est gravement blessé. Lorsque Gibbs tombe dans un guet-apens sur une mission en Iran, que Tony essuie des tirs à son domicile et que Ducky se fait agresser dans son laboratoire, l'équipe reçoit l'aide inattendue de Richard Parsons. Réfugiée en Israël, Ziva est à son tour en danger…