Sous les ordres de la nouvelle secrétaire d'État à la Navy, Sarah Porter, Gibbs et son équipe traquent la confrérie responsable des attentats visant le NCIS. De son côté, Tony part en Israël pour retrouver Ziva. Avec l'aide du Mossad, il tente de comprendre pourquoi sa partenaire semble avoir choisi de disparaître sans laisser de trace.